Странно, я всегда считал что с флешке запуститься системе будет проще чем с диска т.к. доступ к данным гораздо быстрее.
Но оказалось почему-то наоборот.
Хотя возможно причина тут не в этом.
А в том что дистрибутивы для Live USB приобразовываются из Live CD.
Из-за этого возможно и проблема.
По крайней мере у меня на данный момент запустилось 50 на 50 из тех которые пытался запустить.